因为PHPDOC运行的时间比一般的PHP应用要长，很可能会超过你在PHP.INI中定义的最大运行时间（缺省是30秒），根据作者的建议：PIII，60秒，120秒PII，240秒MMX200，480秒如果配置更低的话。如果出现超时，你可以自己适当延长这些数值。

在php.ini中修改：
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
; Resource Limits ;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

max_execution_time = 480
memory_limit = 8388608




如果你不愿意或者没有修改php.ini的权限，那么你可以使用set_time_limit（）函数来设置这个时间，使用方法： set_time_limit(480); 设置从此点开始，运行480秒后才超时。将这个函数加在index.php中，就可以和修改php.ini达到同样的效果。

其次，你要修改phpdoc目录下面的index.php文件：
// Directory with include files
define("PHPDOC_INCLUDE_DIR", "c:/www/apache/doc/");


将"c:/www/apache/doc/修改成你的phpdoc的目录
// Important: set this to the Linebreak sign of your system!
define("LINEBREAK", "\r\n");
这是定义换行的标志，DOS下面是换行+回车，UNIX下面只是回车就可以。

下面，为你的要生成文档的应用程序做一些定制工作：
// Sets the name of your application.
// The name of the application is used e.g. as a page title
$doc->setApplication("PHPDoc");

setApplication（）用来设置你的应用程序的名称，将PHPDOC替换成你应用程序的名字。

// directory where your source files reside:
$doc->setSourceDirectory(PHPDOC_INCLUDE_DIR);

setSourceDirectory（）设置你的应用程序的PHP源文件所在的目录，将PHPDOC_INCLUDE_DIR替换成你实际的目录。

// save the generated docs here:
$doc->setTarget(PHPDOC_INCLUDE_DIR."apidoc/");

setTarget（）设置你的API文档存放的目录，PHPDOC将在这个目录下面生成XML及HTML文件。将PHPDOC_INCLUDE_DIR."apidoc/"替换成你自己的目录。

// use these tem

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